中共巴彦淖尔市委员会机构编制委员会办公室是中共巴彦淖尔市委员会机构编制委员会的办事机构，承担市委编委日常工作，为正处级，列市委工作机关序列，归口市委组织部管理，加挂巴彦淖尔市事业单位登记管理局牌子。具体负责全市行政管理体制改革；事业单位分类改革和综合行政执法改革等重点改革任务；统一管理全市各级机关、事业单位职能配置和机构设置、人员编制、领导职数；统一社会信用代码、事业单位登记；机构编制电子政务、网上名称管理等工作。下设综合科、机构编制一科、机构编制二科（事业单位改革科）、机构编制三科、监督检查科、改革科（政策研究室）、事业单位登记管理科7个内设科室和政务和公益机构域名注册中心、事业单位登记服务中心2个中心。